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Stage 2

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Biochemical analysis Biochemical samples 1. Large bionolecules 일반적으로 3차원 구조를 가진다. - 수용액에서 안정성을 보인다. - Small molecule의 경우 분리/분석에 있어서 구조적인 요인은 미미하다. - Native protein molecule은 3,4차 구조를 가지는게 일반적이다. 2. Denaturation의 과정은 일반적으로 random coil(less folded) 이 되는 과정이다. - 분리과정중 conformation의 변화가 발생할 수 있다. 3. Primary structure - Biochemical macromolecule은 전형적으로 unit의 반복적인 형태이다. - Amino acid의 결합으로 이루어진 peptide, protein이나 oligonucl..
Apoptosis I. Introduction (Reference 참조) 모든 세포는 살아가는 시간이 있음과 동시에 죽어야 되는 시간을 가지고 있다. 세포가 죽는 방법은 두 가지가 있다. - 위험한 물질에 의해 죽는 것(Death by injury) - 자살하도록 유도되는 것.(Death by suicide) 1. Death by injury 기계적인 손상이나 독성 화학물질에 노출되는 경우에 세포들은 죽을 수 있다. 이러한 경우에 세포들은 세포막의 물질투과성 통제력을 잃기 때문에 팽창하게 되고 세포 내용물이 빠져 나오며 유출된 내용물은 주변의 다른 조직을 감염시키게 된다. 2. Death by suicide 자살이 유도된 세포들은 다음의 과정을 보여준다. - 움추려 든다. - 미토콘드리아가 시토크롬C를 방출하고 분해된다...
Mitogen Initiation : Concanavalin A 관련 정보 유사분열 유도 물질 A mitogen is a chemical substance that encourages a cell to commence cell division, triggering mitosis. A mitogen is usually some form of a protein. Mitogenesis is the induction (triggering) of mitosis, typically via a mitogen. Mitogens trigger signal transduction pathways in which mitogen-activated protein kinase (MAPK) is involved, leading to mitosi..
유전자 염기서열을 이용한 종 감별 많은 생물들이 진화를 계속해 오는 과정에서도 변화가 가장 적고 안전하게 유전적 특성이 유지되는 rDNA (Ribosomal DNA)의 염기서열의 비교연구는 넓은 범위의 분류수준에서 유연관계를 분석하는데 가장 유용하다. 진핵 세포의 rDNA는 코딩영역과 비코딩영역으로 구성되어 있다. 또한 rDNA는 진화에 보존적인 영역과 다른 영역보다 빠르게 진화하는 ITS(Internal transcribed spacer)영역 IGS(Intergenic spacer)영역이 있는것으로 알려져 있다. SSU rDNA(Small-subunit rDNA sequences)는 느리게 진화하므로 계를 연구하는데 유용하지만 미토콘드리아 rDNA는 더 빠르게 진화하므로 과의 분류에 이용될 수 있다. ITS와 IGS영역은 각각 다른 비..
HILIC column Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography (HILIC) is a subset of normal phase chromatography where some percentage of the mobile phase contains water, and the organic solvents used are water-miscible. The water molecules in the mobile phase forms a thin aqueous layer on the surface of the stationary phase, and thus, become a part of the semi-permanent stationary phase. Analytes are retained ..
Mass spectrometry introduction (GC/MS) GC/MS (EI 위주로…) 1. 검출기 선택시 고려 사항 가. Selectivity : 분석 대상 화합물에 적합한지? 나. Sensitivity : 분석 대상 화합물에 적합한 감도 (S/N ratio, MDL) 다. Linearity : 정량을 위한 검량선 작성시 직선성이 충분한가? (Linear range, overload) - 직선성 = 최대검출농도 / 최소검출농도 *** MDL 방법검출한계(MDL, method detection limit)란 시료와 비슷한 매질 중에서 시험분석 대상을 검출할 수 있는 최소한의 농도로서, 제시된 정량한계 부근의 농도를 포함하도록 준비한 n 개의 시료를 반복 측정하여 얻은 결과의 표준편차(s)에 99 % 신뢰도에서의 t-분포값을 곱한 것이다. 산출된 방법검출한계는 제..
Trouble shooting : Retention problems 1. What controls retention? 머무름에 영향을 미치는 요소는 이동상, 고정상, 기기문제, 샘플에 주어진 환경으로 나눌수 있다. 여기서는 샘플에 영향을 미치는 환경, 이를테면 화학적 변화, degradation등과 같은 요소는 배제한다. 이동상은 변할수 있다. pH조정이나 부피조정에서 오류가 일어날수 있으며 이러한 이동상에 문제가 예상될 경우 가장 좋은 방법은 이동상을 새로이 제조하는 것이다. 몇몇 이동상은 화학적 변화에의해 degradation이 일어날수 있으며 미생물 증식에 의한 변화, 선택적인 증발 현상등이 일어날수 있다. 그림 1 Degradation of acetonitrile residues using oxidation processes 기기문제로 인한 원인이 예상될 경우에는..
돌비현상 돌비[bumping,突沸 ] 액체가 끓는점이 되어도 끓지 않고, 끓는점 이상으로 가열된 후에 충격을 받거나 이물질등이 첨가되어 갑자기 끓는 현상을 말한다. 이를 막기 위해서는 끓기 전에 액체와 기체가 많이 만날 수 있도록 구멍이 많이 난 물체등을 넣어 끓이거나 모세관으로 공기를 넣으면 된다. 튐이라고도 한다. 1기압에서 물을 가열하면 끓는점 100℃에서 물의 증기압도 1기압이 되므로 액체 표면 뿐 아니라 내부에서도 기화가 시작되어 비등이 일어난다. 그러나 용기 안을 깨끗하게 하고 서서히 가열하면 물의 온도가 100℃에 이르러도 끓지 않고 100℃ 이상이 되는 과열현상이 일어난다. 이 현상은 준안정 상태이므로 외부로부터의 충격이나 먼지가 들어가는 등의 원인으로 한번 기포가 생기기 시작하면 매우 큰 기포를 ..